ويهدف الاتحاد بشكل رئيسي إلى تمكين الجمعيات الأهلية الفلسطينية الأعضاء فيه وتنمية مواردها، ومناصرة حقوقها وقضاياها. كما يهدف إلى دعم أولويات التنمية القطاعية الفلسطينية في مجال الرفاه الاجتماعي والحد من الفقر، الصحة والتعليم، الطفولة، تمكين المرأة والشباب، دمج المعاقين ورعاية المسنين، التنمية البشرية والتخطيط السكاني.

وينتسب للاتحاد أكثر من (120) جمعية أهلية فلسطينية تتخذ من محافظات القدس، بيت لحم، أريحا ورام الله مقراً لها لكنها تنشط في جميع محافظات الوطن ضمن تخصصات ومجالات عمل إنسانية وتنموية مختلفة. ويعتمد الإتحاد في عضويته على شروط عضوية ذات مستويات قياس إدارية ومالية وبرامجية وقانونية مختلفة مع تركيز الاتحاد على العدالة الاجتماعية والتساوي بالفرص للجميع دون التمييز على أساس الجنس أو اللون أو الدين أو الانتماء السياسي أو المعتقد الفكري.